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介绍

Jellyfish是一种快速、高效地计算DNA中k-mer的工具。k-mer是长度为k的子串,计算所有此类子串的出现次数是许多DNA序列分析的核心步骤。通过使用哈希表的有效编码和利用“比较和交换”CPU指令来增加并行性。

关于Jellyfish的更多信息请访问Jellyfish官网

语言:C++。

一句话描述:Jellyfish是一种快速、高效地计算DNA中k-mer的工具。

开源协议:GPL-3.0。

建议的版本

建议使用的版本为“Jellyfish 2.3.0”。