二进制安装Hyper MPI
操作步骤
- 获取二进制安装包。
登录https://kunpeng.huawei.com/#/developer/boostkit/hpc/hypermpi,在“软件下载”区域中,单击目标版本“软件包下载”,获取软件包。
- 使用PuTTY工具,以Hyper MPI安装维护用户,如“hmpi_master”登录作业执行节点。
- 将Hyper MPI安装包“Hyper-MPI_1.1.0_os-platform.tar.gz”上传至服务器。
- os:表示安装包所适用的平台,分为x64和aarch64。
- platform:表示操作系统版本,为CentOS7.6。
- 在“软件下载”区域中,单击“复制MD5码”,获取MD5码。
- 使用md5sum命令生成已下载软件包的MD5校验码,然后与网页上下载的MD5码进行比较。以Hyper MPI安装包“HPC_21.0.RC1_CentOS-aarch64 .tar.gz”为例进行校验:
md5sum Hyper-MPI_1.1.0_CentOS-aarch64.tar.gz
e76d3d64fa6e18f142a4b671a8010955 Hyper-MPI_1.1.0_CentOS-aarch64.tar.gz
如果两个MD5码一致,则说明软件包合法,没有被篡改,可以进行下一步操作。否则应暂停部署,重新获取完整的软件包。
- 执行以下命令,解压Hyper MPI“Hyper-MPI_1.1.0_os-platform.tar.gz”软件包,请根据实际环境获取对应的二进制安装包,例如:Hyper-MPI_1.1.0_CentOS-aarch64.tar.gz。
tar -zxvf Hyper-MPI_1.1.0_os-platform.tar.gz
- 执行以下命令,解压Hyper MPI二进制安装包至安装目录。
tar -zxvf Hyper-MPI_1.1.0_platform_os_GCCVersion_MLNXVersion.tar.gz -C /path/to/install
表1 Hyper MPI二进制包版本说明 项目
说明
platform
安装包所适用的平台,分为x64和aarch64。
os
操作系统版本,为CentOS7.6。
GCCVersion
GCC编译器版本,为GCC9.3.0。
MLNXVersion
Mellanox OFED网卡驱动版本,为MLNX-OFED4.9。
- Hyper-MPI_1.1.0_platform_os_GCCVersion_MLNXVersion.tar.gz:代表Hyper MPI二进制安装包名称,具体以最终下载的安装包名称为准进行替换。
- /path/to/install:代表Hyper MPI的安装目录,用户可自定义,现场请以实际情况进行替换。该文档后续均以安装路径“/path/to/install”为例进行说明及相关操作。使用MPI的用户应具有该目录的访问权限。
配置环境变量
使用MPI的用户,需要配置环境变量。可通过environment-modules工具和写入“~/.bashrc”文件两种方式配置环境变量。
- 方式1:使用environment-modules工具配置环境变量。
- 使用PuTTY工具,以Hyper MPI普通用户,如“hmpi_user”登录作业执行节点。
- 执行以下命令,安装environment-modules工具。
- 执行以下命令,在environment-modules工具安装路径下创建并编辑“Hmpi_modulefiles”配置文件。
- 打开“Hmpi_modulefiles”配置文件。
vi /path/to/install/Hmpi_modulefiles
- 按“i”进入编辑模式,修改如下内容:
#%Module1.0 # HMPI module for use with 'environment-modules' package: conflict mpi prepend-path OPAL_PREFIX /path/to/install/hmpi/ prepend-path PATH /path/to/install/hmpi/bin:/path/to/install/hucx/bin prepend-path LD_LIBRARY_PATH /path/to/install/hmpi/lib:/path/to/install/hucx/lib prepend-path INCLUDE /path/to/install/hmpi/include
/path/to/install:表示environment-modules工具的安装路径。用户若不指定安装路径,则默认安装在“/usr/share/Modules/modulefiles”路径下。
- 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。
- 打开“Hmpi_modulefiles”配置文件。
- 执行以下命令,在工具安装路径下加载环境变量。
module load /path/to/install/Hmpi_modulefiles
- 执行以下命令,将Hyper MPI环境变量写到用户的“~/.bashrc”文件中。
- 打开“~/.bashrc”文件。
vi ~/.bashrc
- 按“i”进入编辑模式,添加如下内容:
module use /path/to/install module load /path/to/install/Hmpi_modulefiles
- 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。
- 打开“~/.bashrc”文件。
- 执行以下命令,使配置生效。
- 方式2:运行Hyper MPI二进制安装包解压目录下的“install.sh”脚本,将Hyper MPI环境变量写到用户的“~/.bashrc”文件中,使其配置生效。
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