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安装HIO桥接目标库

HIO通过桥接目标库来实现应用加速，目前支持加速的应用如表1所示。为了确保实现HIO加速应用，请按照表1选择安装应用运行所需的HIO桥接目标库。

表1 应用版本和目标库映射关系
应用名称	版本	HIO桥接目标库
WRF	4.2.2版本	libpnetcdf.so
NEMO	版本30Nov20	libnetcdf.so
Grapes	CMA_GFS_3.3版本3.3 CMA_MESO版本5.1	libmpi.so
LAMMPS	4.2版本	libhdf5.so或libpnetcdf.so
QE	6.4.1版本	libhdf5.so

安装libhdf5.so

下载hdf5源码压缩包hdf5-1.12.3.tar.gz。
使用SFTP工具将hdf5-1.12.3.tar.gz上传服务器，执行以下命令解压。
tar zxf hdf5-1.12.3.tar.gz
编译安装。
1. 执行以下命令进入hdf5源码目录并创建build目录。
  cd hdf5-1.12.3
  
  mkdir build
2. 执行配置操作。
  cd build
  
  ../configure --prefix=/path/to/hdf5-install
  /path/to/hdf5-install表示libhdf5.so的安装目录，建议与2中的目录区分开。
  批量安装桥接目标库时，安装目录请参见《Kunpeng HPC Solution 24.0.0 LLD模板》中“项目基本信息 > 共享存储目录规划 > HPCKit安装目录”。
3. 执行以下命令编译。
  make -j
4. 执行以下命令安装。
  make install
执行以下命令检查安装目录确认是否包含hdf5动态库。
ls /path/to/hdf5-install/lib

回显如下说明安装目录下已经存在hdf5动态库，表示安装成功。
```
libhdf5.a  libhdf5_hl.a  libhdf5_hl.la  libhdf5_hl.so  libhdf5_hl.so.200  libhdf5_hl.so.200.1.1  libhdf5.la  libhdf5.settings  libhdf5.so  libhdf5.so.200  libhdf5.so.200.3.0
```

安装libnetcdf.so

下载Netcdf源码压缩包netcdf-c-4.9.2.tar.gz。
使用SFTP工具将netcdf-c-4.9.2.tar.gz上传服务器，执行以下命令解压。
tar zxf netcdf-c-4.9.2.tar.gz
编译安装。
1. 执行以下命令进入NetCDF源码目录并创建build目录。
  cd netcdf-c-4.9.2
  
  mkdir build
2. 执行配置操作。
  cd build
  
  ../configure --prefix=/path/to/netcdf-install
  /path/to/netcdf-install表示libnetcdf.so的安装目录，建议与2中的目录区分开
  批量安装桥接目标库时，安装目录请参见《Kunpeng HPC Solution 24.0.0 LLD模板》中“项目基本信息 > 共享存储目录规划 > HPCKit安装目录”。
3. 执行以下命令编译。
  make -j
4. 执行以下命令安装。
  make install
执行以下命令检查安装目录确认是否包含NetCDF动态库。
ls /path/to/netcdf-install/lib
回显如下说明安装目录下已经存在NetCDF相关动态库，表示安装成功。
```
libnetcdf.a  libnetcdf.la  libnetcdf.settings  libnetcdf.so  libnetcdf.so.19  libnetcdf.so.19.2.2  pkgconfig
```

安装libpnetcdf.so

下载PnetCDF源码压缩包pnetcdf-1.12.1.tar.gz。
使用SFTP工具将pnetcdf-1.12.1.tar.gz上传服务器，执行以下命令解压。
tar zxf pnetcdf-1.12.1.tar.gz
编译安装。
1. 进入PnetCDF源码目录并创建build目录。
  cd pnetcdf-1.12.1
  
  mkdir build
2. 执行配置操作。
  cd build
  
  export MPICC=/opt/HPCKit/latest/hmpi/gcc/hmpi/bin/mpicc
  
  ../configure --prefix=/path/to/pnetcdf-install --enable-shared
  /path/to/pnetcdf-install表示libpnetcdf.so的安装目录，建议与2中的目录区分开。
  /opt/HPCKit表示HPCKit安装目录。
  批量安装桥接目标库时，安装目录请参见《Kunpeng HPC Solution 24.0.0 LLD模板》中“项目基本信息 > 共享存储目录规划 > HPCKit安装目录”。
3. 执行以下命令编译。
  make -j
4. 执行以下命令安装。
  make install
执行以下命令检查安装目录确认是否包含PnetCDF动态库。
ls /path/to/pnetcdf-install/lib
回显如下说明安装目录下已经存在PnetCDF相关动态库，表示安装成功。
```
libpnetcdf.a  libpnetcdf.la  libpnetcdf.so  libpnetcdf.so.4  libpnetcdf.so.4.0.1  pkgconfig
```

配置HIO桥目标接库的环境变量

如果HIO桥接目标库在usr/lib64下已存在，则不用配置环境变量，其他情况都需要配置环境变量。
如果多个桥接库不在同一目录下，需要对每个桥接库分别配置环境变量。
以下通过为LD_LIBRARY_PATH配置libpnetcdf.so的环境变为例说明。
用find命令查找HIO桥接目标库所在目录，将该目录配置到环境变量。

仅对当前会话生效：
export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/pnetcdf-install/lib:$LD_LIBRARY_PATH
对当前用户生效：
1. 执行以下命令，进入~/.bashrc文件。
  vim ~/.bashrc
2. 按“i”进入编辑模式，在文件~/.bashrc末尾增加如下命令行。
  export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/pnetcdf-install/lib:$LD_LIBRARY_PATH
3. 按“ESC”退出编辑模式，然后输入":wq!"保存并退出。
4. 执行以下命令，使配置立即生效。
  source ~/.bashrc

父主题： 附录