介绍

SOAPsnp是SOAP(短序列分析软件包)的成员之一，它可以根据新测序个体的原始reads与已有参考序列的比对结果进行序列的一致性组装，从而达到在全基因组水平上扫描并检测SNP的目的。SOAPsnp根据比对的结果，在综合考虑和分析数据特征、测序质量以及实验方面存在的影响因素的基础上，利用贝叶斯模型，在实际观察到的数据基础上计算出每个可能的基因型的似然值，挑选出似然值最大的基因型作为该测序个体特定位点的基因型，并在此基础上给出一个反映该基因型准确度的质量值。

关于SOAPsnp的更多信息请访问SOAPsnp官网。

开发语言：C++。

一句话描述：SOAPsnp是一个短序列分析软件包测序程序。

开源协议：自定义开源。