编译和安装

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. SVN检出获取ROMS源码。

   建立一个新文件夹，将ROMS源码检出到文件夹中，获取源码需要注册帐户。

   cd /path/to/ROMS
   mkdir ROMS_3.6
   svn checkout --username 帐户名 --password 密码 https://www.myroms.org/svn/src/trunk ROMS_3.6

   例如：

   使用HPC/Huawei12#$的帐户及密码进行源码检出，命令如下：

   svn checkout --username HPC --password Huawei12#$ https://www.myroms.org/svn/src/trunk ROMS_3.6

   源码文件结构如下：

   

3. 自定义build脚本。
   1. 为了在使用中对源码内容不做修改，执行以下命令，新建“ROMSProjects”文件夹用于ROMS的编译运行，upwelling是源码包中自带的默认算例。

      cd /path/to/ROMS
      mkdir ROMSProjects
      cd ROMSProjects
      mkdir upwelling
      cd upwelling

   2. 执行以下命令，在源码的“ROMS/Bin”目录下，存在“build.sh”和“build.bash”文件，在当前环境下使用“.bash”文件，复制“build.bash”文件到“upwelling”目录中。

      cp /path/to/ROMS/ROMS_3.6/ROMS/Bin/build.bash .

   3. 执行以下命令编辑“build.bash”文件。
      1. 打开“build.bash”文件。

         vi build.bash

      2. 按“i”进入编辑模式，修改以下内容。

         export ROMS_APPLICATION=UPWELLING

         export MY_ROOT_DIR=/path/to/ROMS
         export MY_PROJECT_DIR=${MY_ROOT_DIR}/ROMSProjects/upwelling

         export MY_ROMS_SRC=/path/to/ROMS/ROMS_3.6

         export USE_MPI=on
         export USE_MPIF90=on
         export which_MPI=openmpi

         export FORT=gfortran

         export USE_LARGE=on
         export USE_NETCDF4=on
         export USE_PARALLEL_IO=on

         export PATH=/path/to/OPENMPI/bin:$PATH

         export NF_CONFIG=/path/to/NETCDF/bin/nf-config
         export NETCDF_INCDIR=/path/to/NETCDF/include
         export NETCDF_LIBDIR=/path/to/NETCDF/lib

      3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
4. 执行以下命令复制输入和配置文件。

   cp /path/to/ROMS/ROMS_3.6/ROMS/External/ocean_upwelling.in .
   cp /path/to/ROMS/ROMS_3.6/ROMS/External/varinfo.dat
   cp /path/to/ROMS/ROMS_3.6/ROMS/Include/upwelling.h .

5. 执行以下命令编辑“ocean_upwelling.in”文件。
   1. 打开“ocean_upwelling.in”文件。

      vi ocean_upwelling.in

   2. 按“i”进入编辑模式，修改“ocean_upwelling.in”文件。
      修改文件中“VARNAME”为“varinfo.dat”的路径，注意粗体部分。

      VARNAME = /path/to/ROMS/ROMSProjects/upwelling/varinfo.dat

      设置“NtileI”、“NtileJ”，二者的乘积应与运行时设置的np相等，例如np设置为96时，“NtileI”、“NtileJ”可以设置如下值，注意粗体部分。

      NtileI == 6
      NtileJ == 16

      

      NtileI、NtileJ的设置规则参考故障排除。

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
6. 执行以下命令编译ROMS。

   ./build.bash -j 8

   在使用MPI的情况下，编译成功将生成可执行文件“OceanM”，可使用ls命令进行查看。

   ll /path/to/ROMS/ROMSProjects/upwelling

   -rwxr-xr-x 1 root root 1671056 Aug 15 18:41 oceanM