中文
注册
我要评分
文档获取效率
文档正确性
内容完整性
文档易理解
在线提单
论坛求助

环境要求

硬件要求

硬件要求如表1所示。

表1 硬件要求

项目

说明

CPU

鲲鹏920处理器

软件要求

软件要求如表2所示。

表2 软件要求

项目

版本

下载地址

PASA

2.4.1

https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/archive/pasa-v2.4.1.tar.gz

URI

1.35

http://search.cpan.org/CPAN/authors/id/G/GA/GAAS/URI-1.35.tar.gz

blat

35.1

https://codeload.github.com/djhshih/blat/tar.gz/v35.1

gmap

2015-09-21

http://research-pub.gene.com/gmap/src/gmap-gsnap-2015-09-21.tar.gz

samtools

0.1.9

https://codeload.github.com/samtools/samtools/tar.gz/0.1.9

mariadb

5.5.60

CentOS 7.6镜像自带。

测试算例

genome_sample.fasta

软件自带算例。

all_transcripts.fasta.clean

all_transcripts.fasta

FL_accs.txt

操作系统要求

操作系统要求如表3所示。

表3 操作系统要求

项目

版本

下载地址

CentOS

7.6

https://www.centos.org/download/

Kernel

4.14.0-115

包含在操作系统镜像中。