基本安装

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令创建主程序安装目录。

   mkdir -p /path/to/MAFFT

3. 复制安装包至主程序安装目录。

   cp mafft-7.471-without-extensions-src.tgz  /path/to/MAFFT

4. 执行以下命令进入主程序安装目录。

   cd /path/to/MAFFT

5. 执行以下命令解压安装包。

   tar -xvf  mafft-7.471-without-extensions-src.tgz

6. 执行以下命令进入解压后的目录。

   cd mafft-7.471-without-extensions/core

7. 执行以下命令配置相关文件。

   perl -p -i -e 's#PREFIX =.*#PREFIX = /PATH/to/MAFFT#' Makefile
   sed -i 's/gcc/\`which gcc\`/g' Makefile
   sed -i 's/-O3/-O3 -march=armv8.2-a -mtune=tsv110 -flto/g' Makefile

8. 编译安装MAFFT主程序。
   1. 执行以下命令编译安装主程序。

      make clean
      make
      make install

   2. 执行以下命令添加环境变量。

      export PATH=/path/to/MAFFT/bin:$PATH