安装htslib

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入htslib安装目录。

   cd /path/to/HTSLIB

3. 执行以下命令解压htslib安装包。

   tar -xvf htslib-1.9.tar.bz2

4. 执行以下命令进入解压后的目录。

   cd htslib-1.9

5. 执行以下命令修改“Makefile”文件。
   1. 打开“Makefile”文件。

      vi Makefile

   2. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。

      修改前：

      CC     = gcc 

      修改后：

      CC     = /path/to/GNU/bin/gcc 

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
6. 执行以下命令进行编译安装。

   make

7. 执行以下命令将生成的文件拷贝到根目录默认路径中，可以使Cufflinks直接识别htslib文件。

   cp /path/to/HTSLIB/htslib-1.9/libhts.* /usr/local/lib