运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令创建并进入工作目录。

   mkdir -p /path/to/CASE
   cd /path/to/CASE

3. 下载算例文件，使用SFTP工具将其上传到工作目录“/path/to/CASE”下。
4. 执行以下命令开始测试。

   { time cnvnator -root B17NC.root -tree B17NC.bam ; } 2>&1 |tee -a Mapping.log
   { time cnvnator -root B17NC.root -his 1000 -fasta chr14.GRCm38.primary_assembly.genome.fa.gz ; } 2>&1 |tee -a Histogram.log
   { time cnvnator -root B17NC.root -stat 1000 ; } 2>&1 |tee -a Statistics.log

   输出信息如图1所示，则计算运行正常结束。

   图1 测试样例