调试MPI应用

编写语言：C/C++

1. 单击左侧树快捷功能区按钮，或单击“开发”选择编译调试下方的“调试”，打开调试页面，选择“HPC并行应用”，配置MPI应用调试参数，如图1所示。
   图1 HPC并行应用调试
   
   

   调试MPI应用无需打开“OpenMP应用”参数。

   表1 HPC并行应用调试参数说明

   参数	说明
   远程服务器配置	进行HPC并行应用调试的目标服务器。
   Linux用户名	输入启动MPI应用的Linux用户名称。 说明： root用户拥有最高权限，为了避免给系统带来不必要的风险，建议使用非root用户进行调试。
   Linux用户密码	使用的Linux用户密码。
   记住密码	勾选后可记住当前远程服务器Linux用户密码。
   SSH端口	输入启动MPI应用的服务器SSH端口号。
   应用程序	输入的MPI应用，支持动态检索并显示应用程序路径。 请给Linux用户添加当前MPI应用的可读权限以及应用所在目录的可读、可写和可执行权限。 说明： MPI应用要为可执行文件。 若MPI应用中无源码信息，则调试器默认以汇编形式进行调试。
   应用程序参数（可选）	传递给应用程序运行的参数。 请给Linux用户添加应用程序所在目录的可读、可写、可执行权限及应用程序所在目录父目录的可执行权限。
   应用程序源码路径	源码和MPI应用存放的共享路径，支持动态检索并显示应用程序源码路径。 若MPI应用已配置共享路径，源码与MPI应用都应存放在共享路径下。 请给Linux用户添加当前MPI应用源码路径的可读、可执行权限及源码文件所在目录父目录的可执行权限。
   环境变量设置（可选）	输入运行HPC并行应用所需要的环境变量，有以下3种方式可选择，可根据实际情况进行修改。 export PATH=$PATH:/path/to/mpi source /configure/mpi/path/file module load/mpi/modulefiles
   调试启动方式	调试启动方式可选： mpirun命令运行方式 多瑙调度器运行方式 Slurm调度器运行方式 说明： mpirun命令运行方式使用mpirun运行命令，mpirun是一个重要的工具，用作启动MPI并行应用程序，并提供进程之间的通信和清理工作等功能。 多瑙调度器是华为全自研的HPC集群调度器，提供大规模集群下的高资源利用率、高吞吐量的作业调度能力。 Slurm是一个开源的、高度可定制的、可扩展的、高性能的作业调度系统，它能够很好地提供资源管理和任务调度功能，广泛用于高性能计算、集群计算领域，如物理、化学、生物学、天文学等领域。
   MPI运行命令行	输入的mpirun命令以及对应的命令参数，rank数目为1~2048。
   多瑙调度器运行命令行	输入的多瑙调度器命令以及对应的命令参数。
   Slurm调度器运行命令行	输入的Slurm调度器命令以及对应的命令参数。
   OpenMP应用（可选）	勾选后，需要输入OpenMP线程数。
   OpenMP线程数（可选）	输入的OpenMP应用thread数量。
   死锁检测（可选）	勾选后，需要输入死锁超时时间。
   死锁超时时间（s）（可选）	死锁超时时间，默认为10秒，取值范围10~60。

2. 配置完成后，单击“开始调试”，右下角弹框提示“HPC并行应用调试启动中”，检测所输入的配置信息是否正确，若检测结果错误，请根据提示信息进行处理。若检测成功，右下角弹出弹框提示rank状态读取中，如图2所示。
   图2 rank状态读取中
   
   

   若HPC并行应用调试启动失败，请参见HPC并行应用调试启动失败的解决办法进行处理。

3. 在rank状态读取过程中，若rank状态读取存在失败，请根据提示下载最新日志文件了解失败详情。如图3所示。
   图3 rank状态读取失败
   
4. 在rank状态读取过程中，若rank状态读取全部成功，会自动跳转到MPI应用调试页面。页面上获取到运行和调试区、源码区和调试功能区，运行和调试区域包括调试信息区和RANK信息区，如图4所示。
   图4 rank状态读取成功
   
5. MPI应用支持三种调试粒度，分别为“全部”调试、“rank”调试或“通信组”调试，还可以选择调试功能区的其他操作按钮来进行调试操作。如表2所示。

   表2 调试按钮操作描述

   操作	操作描述
   继续	点击执行到下一个断点
   暂停	点击中断正在执行的程序
   单步跳过	点击执行到下一行
   单步调试	点击步入函数
   单步跳出	点击步出函数
   重启	点击后重新启动调试
   停止	点击后停止调试

   

   1. 调试方式
      • 以“全部”方式进行调试，选择某一个rank，会对全部rank进行调试，在rank信息区域所有通信组右侧显示定位图标。
      • 以“rank”方式进行调试，对单一rank进行调试，在rank信息区域对应rank右侧显示定位图标。
      • 以“通信组”方式进行调试，选择通信组中的某一个rank，会对其对应的通信组进行调试，在RANK信息区域对应rank的通信组右侧显示定位图标。
   2. 设置断点
      • 进行调试时，当前调试的代码行会高亮显示，在代码行号处单击，会设置上断点标记。
   3. rank状态展示
      • rank前的状态灯表示当前rank的状态，绿色表示rank停止，红色表示rank正在运行，灰色表示rank已退出。
6. 单击调试功能区的按钮，将重新启动MPI应用调试，重启后右下角弹出弹框提示rank状态读取中，读取成功后打开MPI应用调试页面。
   图5 重启调试任务
   
7. 单击左侧调试信息区域会显示对应的变量（Locals、Register）、监视、断点和调用堆栈信息。
   1. 在调试过程中可以修改变量值，右击变量表达式，可设置变量值，也可将变量表达式添加到监视中（Register表达式不能添加到监视中）；
   2. 在监视区域中，支持添加、修改、单个删除、全部删除监视表达式，仅支持C/C++语言格式的表达式。
   展开调试信息如图6所示。

   图6 调试信息
   

   

   1. 单击调用堆栈区域展开显示堆栈信息，包含函数名、文件名、当前运行的行数和地址。
   2. 在调试信息区单击某个堆栈，源码区会切换到对应的源码或汇编语言。
8. 在RANK信息区域单击按钮，在VS Code面板显示“通信子组变化”页面。
   • 单击“变化概览”，显示通信子组的变化概览，每100ms显示通信子组的变化。通信子组的变化用不同颜色的菱形来区分，蓝色表示通信子组创建，紫色表示通信子组清除，黄色表示100ms内存在通信子组创建和通信子组清除。
     图7 通信子组变化概览
     

     鼠标悬浮到菱形上，显示通信子组变化的详细信息。

     图8 通信子组悬浮信息
     
   • 单击“变化详情”，显示通信子组的变化详情，鼠标悬浮到对应位置会显示所属通信子组以及rank信息。
     图9 通信子组变化详情
     
   • 调试过程中若检测到死锁，提示通信组发生死锁，单击“查看详情”或“死锁”，显示死锁详细信息，如死锁状态图以及表格信息。表格展示rank、源进程（rank）、目标进程（rank）、标记、数据大小（byte）和调用栈信息。
     图10 通信子组死锁详情
     

     若未单击按钮，调试过程中发生死锁，右下角弹框会提示检测到死锁，如图11所示，单击“查看详情”，跳转到死锁页面，查看通信组死锁的详细信息。

     图11 检测到死锁
     
     

     在RANK信息区域，单击按钮，开启后对通信子组的创建和清除进行采集，并在VS Code面板上显示变化概览。

     在通信子组变化概览页面中，单击“通信子组创建”、“通信子组清除”或“通信子组创建并清除”，可以不查看对应相关信息。

     死锁是指两个或多个进程各自在等待另一个进程释放资源，或两个或多个进程在循环链中等待资源的情况。在MPI应用中进行点对点通信时，MPI点对点函数顺序不当则会发生死锁的现象。

编写语言：Fortran

Fortran是目前国际上广泛流行的一种高级语言，适用于科学计算。Fortran也是一种编译型语言，源代码必须通过编译器以生成的可以运行的机器可执行文件。安装编译器GFortran参考链接：https://gcc.gnu.org/fortran/。

Fortran90程序是一种分块形式的程序，整个程序由若干个程序模块组成，各模块都有相似的语句组织形式，其中主程序起整体控制作用，各辅程序模块各自完成问题中的一个算法。Fortran95是对Fortran90的补充，两者差别不大，都可支持调试。

1. 单击左侧树快捷功能区按钮，或单击“开发”选择编译调试下方的“调试”，打开调试页面，选择“HPC并行应用”，配置MPI应用调试参数，如图12所示。
   图12 HPC并行应用调试
   
   

   调试MPI应用无需打开“OpenMP应用”参数。

   Fortran文件扩展名为.f90，.f90是现代Fortran源文件的标准文件扩展名。 90指的是1990年的第一个现代Fortran标准。

   表3 HPC并行应用调试参数说明

   参数	说明
   远程服务器配置	进行HPC并行应用调试的目标服务器。
   Linux用户名	输入启动MPI应用的Linux用户名称。 说明： root用户拥有最高权限，为了避免给系统带来不必要的风险，建议使用非root用户进行调试。
   Linux用户密码	使用的Linux用户密码。
   记住密码	勾选后可记住当前远程服务器Linux用户密码。
   SSH端口	输入启动MPI应用的服务器SSH端口号。
   应用程序	输入的MPI应用，支持动态检索并显示应用程序路径。 请给Linux用户添加当前MPI应用的可读权限以及应用所在目录的可读、可写和可执行权限。 说明： MPI应用要为可执行文件。 若MPI应用中无源码信息，则调试器默认以汇编形式进行调试。
   应用程序参数（可选）	传递给应用程序运行的参数。 请给Linux用户添加应用程序所在目录的可读、可写、可执行权限及应用程序所在目录父目录的可执行权限。
   应用程序源码路径	源码和MPI应用存放的共享路径，支持动态检索并显示应用程序源码路径。 若MPI应用已配置共享路径，源码与MPI应用都应存放在共享路径下。 请给Linux用户添加当前MPI应用源码路径的可读、可执行权限及源码文件所在目录父目录的可执行权限。
   环境变量设置（可选）	输入运行HPC并行应用所需要的环境变量，有以下3种方式可选，可根据实际情况进行修改。 export PATH=$PATH:/path/to/mpi source /configure/mpi/path/file module load/mpi/modulefiles
   调试启动方式	调试启动方式可选： mpirun命令运行方式 多瑙调度器运行方式 Slurm调度器运行方式 说明： mpirun命令运行方式使用mpirun运行命令，mpirun是一个重要的工具，用作启动MPI并行应用程序，并提供进程之间的通信和清理工作等功能。 多瑙调度器是华为全自研的HPC集群调度器，提供大规模集群下的高资源利用率、高吞吐量的作业调度能力。 Slurm是一个开源的、高度可定制的、可扩展的、高性能的作业调度系统，它能够很好地提供资源管理和任务调度功能，广泛用于高性能计算、集群计算领域，如物理、化学、生物学、天文学等领域。
   MPI运行命令行	输入的mpirun命令以及对应的命令参数，rank数目为1~2048。
   多瑙调度器运行命令行	输入的多瑙调度器命令以及对应的命令参数。
   Slurm调度器运行命令行	输入的Slurm调度器命令以及对应的命令参数。
   OpenMP应用（可选）	勾选后，需要输入OpenMP线程数。
   OpenMP线程数（可选）	输入的OpenMP应用thread数量。
   死锁检测（可选）	勾选后，需要输入死锁超时时间。
   死锁超时时间（s）（可选）	死锁超时时间，默认为10秒，取值范围10~60。

2. 配置完成后，单击“开始调试”，右下角弹框提示“HPC并行应用调试启动中”，检测所输入的信息是否正确，若检测结果错误，请根据提示信息进行处理。若检测成功，右下角弹出弹框提示rank状态读取中，如图13所示。
   图13 rank状态读取中
   
   

   若HPC并行应用调试启动失败，请参见HPC并行应用调试启动失败的解决办法进行处理。

3. 在rank状态读取过程中，若rank状态读取存在失败，请根据提示下载日志文件了解失败详情。如图14所示。
   图14 rank状态读取失败
   
4. 在rank状态读取过程中，若rank状态读取全部成功，会自动跳转到MPI应用调试页面。页面上获取到运行和调试区、源码区和调试功能区，运行和调试区域包括调试信息区和RANK信息区，如图15所示。
   图15 rank状态读取成功
   
5. MPI应用支持三种调试粒度，分别为“全部”调试、“rank”调试或“通信组”调试，还可以选择调试功能区的其他操作按钮来进行调试操作。如表4所示。

   表4 调试按钮操作描述

   操作	操作描述
   继续	点击执行到下一个断点
   暂停	点击中断正在执行的程序
   单步跳过	点击执行到下一行
   单步调试	点击步入函数
   单步跳出	点击步出函数
   重启	点击后重新启动调试
   停止	点击后停止调试

   

   1. 调试方式
      • 以“全部”方式进行调试，选择某一个rank，会对全部rank进行调试，在rank信息区域所有通信组右侧显示定位图标。
      • 以“rank”方式进行调试，对单一rank进行调试，在rank信息区域对应rank右侧显示定位图标。
      • 以“通信组”方式进行调试，选择通信组中的某一个rank，会对其对应的通信组进行调试，在RANK信息区域对应rank的通信组右侧显示定位图标。
   2. 设置断点
      • 进行调试时，当前调试的代码行会高亮显示，在代码行号处单击，会设置上断点标记。
   3. rank状态展示
      • rank前的状态灯表示当前rank的状态，绿色表示rank停止，红色表示rank正在运行，灰色表示rank已退出。
6. 单击按钮，弹出重启任务弹框，单击“确定”将重新启动编译任务，跳转到rank状态读取页面，读取成功后重新打开MPI应用调试页面。
   图16 重启任务
   
7. 单击左侧调试信息区域会显示对应的变量（Locals、Register）、监视、断点和调用堆栈信息。
   1. 在调试过程中可以修改变量值，右击变量表达式，可设置变量值，也可将变量表达式添加到监视中（Register表达式不能添加到监视中）；
   2. 在监视区域中，支持添加、修改、单个删除、全部删除监视表达式，仅支持C/C++语言格式的表达式。
   展开调试信息如图17所示。

   图17 调试信息
   

   

   1. 单击调用堆栈区域展开显示堆栈信息，包含函数名、文件名、当前运行的行数和地址。
   2. 在调试信息区单击某个堆栈，源码区会切换到对应的源码或汇编语言。
8. 在RANK信息区域单击按钮，在VS Code面板显示“通信子组变化”页面。
   • 单击“变化概览”，显示通信子组的变化概览，每100ms显示通信子组的变化。通信子组的变化用不同颜色的菱形来区分，蓝色表示通信子组创建，紫色表示通信子组清除，黄色表示100ms内存在通信子组创建和通信子组清除。
     图18 通信子组变化概览
     

     鼠标悬浮到菱形上，显示通信子组变化的详细信息。

     图19 通信子组悬浮信息
     
9. 单击“查看详情”按钮，切换到通信组变化详情页面，鼠标悬浮到对应位置会显示所属通信子组以及rank信息。
   图20 通信组变化详情
   
   

   在RANK信息区域，单击按钮，点击后在界面下方展示通信子组的创建和清除信息。

   在通信子组变化概览页面中，单击“通信子组创建”、“通信子组清除”或“通信子组创建并清除”，可以不查看对应相关信息。