编译和安装

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令解压并配置BLAST路径。

   tar xzf ncbi-blast-2.9.0+-src.tar.gz
   cd ncbi-blast-2.9.0+-src
   export BLAST_TOP=`pwd`

3. 执行以下命令设置编译器。

   export CC=gcc
   export CXX=g++

4. 使用SFTP工具将“LMDB_0.9.24.tar.gz”上传到“/path/to/BLAST/ncbi-blast-2.9.0+-src”目录下。
5. 执行以下命令解压并配置LMDB路径。

   cd $BLAST_TOP
   tar -xvf LMDB_0.9.24.tar.gz
   cd lmdb-LMDB_0.9.24
   export LMDB_PATH=$BLAST_TOP/lmdb-LMDB_0.9.24

6. 执行以下命令编译安装BLAST。

   cd $BLAST_TOP/c++
   ./configure
   cd ReleaseMT/build
   make all_r -j40

7. 安装成功后可执行文件会生成在“$BLAST_TOP/c++/ReleaseMT/bin”目录下，可执行以下命令进行查看。

   cd $BLAST_TOP/c++/ReleaseMT/bin
   ls blastp
   blastp