文档HOT
中文
注册
我要评分
文档获取效率
文档正确性
内容完整性
文档易理解
提交
在线提单
论坛求助

源码安装Hyper MPI（开源组件）

前提条件

已完成以下依赖包的安装。
表1 每种操作系统需安装的依赖包

操作系统

依赖包
  • CentOS Linux release 7.6 AArch64
  • CentOS Linux release 8.2 AArch64
  • Kylin Linux Advanced Server V10 SP2 AArch64
  • 银河麒麟高级服务器操作系统V10（HPC版） AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）
  • 麒麟信安服务器操作系统V3.5.2 AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）
  • openEuler 20.03 LTS SP3 AArch64
  • openEuler 22.03 LTS SP2 AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）
  • perl-Data-Dumper
  • autoconf
  • automake
  • Libtool
  • GCC编译器10.3.1或毕昇编译器3.1.0
    说明：

    需要同时支持C、C++和Fortran语言的编译器。

    • GCC编译器10.3.1包括gcc、g++和gfortran。
    • 毕昇编译器3.1.0包括clang、clang++和flang。
  • libstdc++
  • numactl
  • libnuma-dev
  • binutils
  • systemd-devel
  • valgrind
  • cmake3
  • Flex

Ubuntu 18.04.5 LTS arm64
  • libdata-dumper-simple-perl
  • autoconf
  • automake
  • Libtool
  • GCC编译器10.3.1或毕昇编译器3.1.0
    说明：

    需要同时支持C、C++和Fortran语言的编译器。

    • GCC编译器10.3.1包括gcc、g++和gfortran。
    • 毕昇编译器3.1.0包括clang、clang++和flang。
  • numactl
  • numactl-devel
  • binutils
  • libsystemd-dev
  • valgrind
  • cmake3
  • Flex

编译环境变量检查

  1. 使用PuTTY工具，以Hyper MPI安装维护用户（例如“hmpi_master”）登录至作业执行节点。
  2. 执行以下命令，检查GCC 10.3.1/毕昇编译器3.1.0是否安装。
    • GCC 10.3.1

      gcc -v

      检查回显信息中是否包含GCC 10.3.1。

    • 毕昇编译器3.1.0

      clang -v

      检查回显信息中是否包含毕昇编译器，且版本号是否正确。

  3. 执行以下命令，检查Libtool是否安装。

    libtool --version

    回显如下类似信息，说明已安装Libtool。

    libtool (GNU libtool) 2.4.2

GCC编译Hyper MPI软件包

Hyper MPI包含Hyper MPI、HUCX和XUCG三个软件层，其中Hyper MPI的安装依赖于HUCX和XUCG，编译顺序应为编译HUCX > 编译XUCG > 编译Hyper MPI。

  1. 编译HUCX。
    1. 使用PuTTY工具，以Hyper MPI安装维护用户（例如“hmpi_master”）登录至作业执行节点。
    2. 下载HUCX源码包“hucx-v2.3.0-huawei.tar.gz”。

      下载地址：https://gitee.com/kunpengcompute/hucx/repository/archive/v2.3.0-huawei.tar.gz

    3. 将上述源码包上传至服务器HUCX源码包安装目录，如“/path/to/download/hucx”。
    4. 执行以下命令，进入HUCX源码包安装路径。

      cd /path/to/download/hucx

    5. 执行以下命令，解压上述源码包。

      tar -zxvf hucx-v2.3.0-huawei.tar.gz

    6. 执行以下命令，进入“autogen.sh”脚本所在目录。

      cd hucx-v2.3.0-huawei

    7. 执行以下命令，进行源码包安装。

      ./autogen.sh

      ./contrib/configure-opt --prefix=/path/to/install/hucx --enable-mt CC=gcc CXX=g++ FC=gfortran

      • 若需要支持GPU Aware功能，且环境上已安装CUDA，则需要执行以下命令，指定--with-cuda参数：

        ./contrib/configure-opt --prefix=/path/to/install/hucx --with-cuda=/path/to/install/cuda --enable-mt CC=gcc CXX=g++ FC=gfortran

      • 环境上若没有安装numactl插件，则需要执行以下命令，指定--disable-numa参数：

        ./contrib/configure-opt --prefix=/path/to/install/hucx --disable-numa --enable-mt CC=gcc CXX=g++ FC=gfortran

      • /path/to/install/hucx：表示HUCX的安装路径。
      • /path/to/install/cuda：表示CUDA的安装路径。

      make -j32

      make -j32 install

      make后面-j参数为并行编译参数，表示有多少CPU核数参与编译过程，请根据实际CPU核数进行指定。

    8. 执行以下命令，加载HUCX环境变量。

      export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/install/hucx/lib:$LD_LIBRARY_PATH

      export C_INCLUDE_PATH=/path/to/install/hucx/include:$C_INCLUDE_PATH

      export CPLUS_INCLUDE_PATH=/path/to/install/hucx/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH

  2. 编译XUCG。
    1. 使用PuTTY工具，以Hyper MPI安装维护用户（例如“hmpi_master”）登录至作业执行节点。
    2. 下载XUCG源码包“xucg-v2.3.0-huawei.tar.gz”。

      下载地址：https://gitee.com/kunpengcompute/xucg/repository/archive/v2.3.0-huawei.tar.gz

    3. 将上述源码包上传至服务器XUCG源码包安装目录，如“/path/to/download/xucg”。
    4. 执行以下命令，进入XUCG源码包安装路径。

      cd /path/to/download/xucg

    5. 执行以下命令，解压上述源码包。

      tar -zxvf xucg-v2.3.0-huawei.tar.gz

    6. 执行以下命令，进入“CMakeLists.txt”所在目录。

      cd xucg-v2.3.0-huawei/

    7. 执行以下命令，进行源码包安装。

      mkdir build && cd build

      cmake3 .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/path/to/install/xucg -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -DUCG_BUILD_WITH_UCX=/path/to/install/hucx -DUCG_ENABLE_MT=ON -DUCG_BUILD_TESTS=OFF -DCMAKE_C_COMPILER=gcc -DCMAKE_CXX_COMPILER=g++ -DCMAKE_Fortran_COMPILER=gfortran

      /path/to/install/xucg：表示XUCG的安装路径。

      make -j32

      make -j32 install

      make后面-j参数为并行编译参数，表示有多少CPU核数参与编译过程，请根据实际CPU核数进行指定。

    8. 执行以下命令，加载XUCG环境变量。

      export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/install/xucg/lib:$LD_LIBRARY_PATH

      export C_INCLUDE_PATH=/path/to/install/xucg/include:$C_INCLUDE_PATH

      export CPLUS_INCLUDE_PATH=/path/to/install/xucg/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH

  3. 编译Hyper MPI。
    1. 使用PuTTY工具，以Hyper MPI安装维护用户（例如“hmpi_master”）登录至作业执行节点。
    2. 下载Hyper MPI源码包“hmpi-v2.3.0-huawei.tar.gz”。

      下载地址：https://gitee.com/kunpengcompute/hmpi/repository/archive/v2.3.0-huawei.tar.gz

    3. 将源码包上传至服务器Hyper MPI源码包安装目录，如“/path/to/download/hmpi”。
    4. 执行以下命令，进入源码包安装目录。

      cd /path/to/download/hmpi

    5. 执行以下命令，解压软件包。

      tar -zxvf hmpi-v2.3.0-huawei.tar.gz

    6. 执行以下命令，进入“autogen.pl”脚本所在目录。

      cd hmpi-v2.3.0-huawei/

    7. 执行以下命令，进行Hyper MPI源码包安装。

      ./autogen.pl

      ./configure --prefix=/path/to/install/hmpi --with-platform=contrib/platform/mellanox/optimized --enable-mpi1-compatibility --with-ucx=/path/to/install/hucx --with-ucg=/path/to/install/xucg CC=gcc CXX=g++ FC=gfortran

      make

      make install

      • 若需要支持GPU Aware功能，且环境上已安装CUDA，则需要执行以下命令，指定--with-cuda参数：

        ./configure --prefix=/path/to/install/hmpi --with-platform=contrib/platform/mellanox/optimized --with-cuda=/path/to/install/cuda --enable-mpi1-compatibility --with-ucx=/path/to/install/hucx --with-ucg=/path/to/install/xucg CC=gcc CXX=g++ FC=gfortran

      • /path/to/install/hmpi：表示Hyper MPI的安装路径。
      • /path/to/install/cuda：表示CUDA的安装路径。
      • /path/to/install/hucx：表示HUCX的安装路径。
      • /path/to/install/xucg：表示XUCG的安装路径。

毕昇编译Hyper MPI软件包

Hyper MPI包含Hyper MPI、HUCX和XUCG三个软件层，其中Hyper MPI的安装依赖于HUCX和XUCG，编译顺序应为编译HUCX > 编译XUCG > 编译Hyper MPI。

  1. 编译HUCX。
    1. 使用PuTTY工具，以Hyper MPI安装维护用户（例如“hmpi_master”）登录至作业执行节点。
    2. 下载HUCX源码包“hucx-v2.3.0-huawei.tar.gz”。

      下载地址：https://gitee.com/kunpengcompute/hucx/repository/archive/v2.3.0-huawei.tar.gz

    3. 将上述源码包上传至服务器HUCX源码包安装目录，如“/path/to/download/hucx”。
    4. 执行以下命令，进入HUCX源码包安装路径。

      cd /path/to/download/hucx

    5. 执行以下命令，解压上述源码包。

      tar -zxvf hucx-v2.3.0-huawei.tar.gz

    6. 执行以下命令，进入“autogen.sh”脚本所在目录。

      cd hucx-v2.3.0-huawei/

    7. 安装源码包。
      • 毕昇编译器为3.0.0及以上版本，请执行以下命令，进行源码安装。

        ./autogen.sh

        ./contrib/configure-opt --prefix=/path/to/install/hucx CFLAGS="-Wno-unused-but-set-variable" --enable-mt CC=clang CXX=clang++ FC=flang

      • 毕昇编译器为3.0.0以下版本，请执行以下命令，进行源码安装。

        ./autogen.sh

        ./contrib/configure-opt --prefix=/path/to/install/hucx --enable-mt CC=clang CXX=clang++ FC=flang

      • 若需要支持GPU Aware功能，且环境上已安装CUDA，请执行以下命令，指定--with-cuda参数：
        • 毕昇编译器为3.0.0及以上版本

          ./autogen.sh

          ./contrib/configure-opt --prefix=/path/to/install/hucx --with-cuda=/path/to/install/cuda CFLAGS="-Wno-unused-but-set-variable" --enable-mt CC=clang CXX=clang++ FC=flang

        • 毕昇编译器为3.0.0以下版本

          ./autogen.sh

          ./contrib/configure-opt --prefix=/path/to/install/hucx --with-cuda=/path/to/install/cuda --enable-mt CC=clang CXX=clang++ FC=flang

      • 若没有安装numactl插件，则需要执行以下命令，指定--disable-numa参数：
        • 毕昇编译器为3.0.0及以上版本

          ./autogen.sh

          ./contrib/configure-opt --prefix=/path/to/install/hucx CFLAGS="-Wno-unused-but-set-variable" --disable-numa --enable-mt CC=clang CXX=clang++ FC=flang

        • 毕昇编译器为3.0.0以下版本

          ./autogen.sh

          ./contrib/configure-opt --prefix=/path/to/install/hucx --disable-numa --enable-mt CC=clang CXX=clang++ FC=flang

      • /path/to/install/hucx：表示HUCX的安装路径。
      • /path/to/install/cuda：表示CUDA的安装路径。

      make -j32

      make -j32 install

      make后面-j参数为并行编译参数，表示有多少CPU核数参与编译过程，请根据实际CPU核数进行指定。

    8. 执行以下命令，加载HUCX环境变量。

      export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/install/hucx/lib:$LD_LIBRARY_PATH

      export C_INCLUDE_PATH=/path/to/install/hucx/include:$C_INCLUDE_PATH

      export CPLUS_INCLUDE_PATH=/path/to/install/hucx/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH

  2. 编译XUCG。
    1. 使用PuTTY工具，以Hyper MPI安装维护用户（例如“hmpi_master”）登录至作业执行节点。
    2. 下载XUCG源码包“xucg-v2.3.0-huawei.tar.gz”。

      下载地址：https://gitee.com/kunpengcompute/xucg/repository/archive/v2.3.0-huawei.tar.gz

    3. 将上述源码包上传至服务器XUCG源码包安装目录，如“/path/to/download/xucg”。
    4. 执行以下命令，进入XUCG源码包安装路径。

      cd /path/to/download/xucg

    5. 执行以下命令，解压上述源码包。

      tar -zxvf xucg-v2.3.0-huawei.tar.gz

    6. 执行以下命令，进入“CMakeLists.txt”所在目录。

      cd xucg-v2.3.0-huawei/

    7. 执行以下命令，进行源码包安装。

      mkdir build && cd build

      cmake3 .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/path/to/install/xucg -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -DUCG_BUILD_WITH_UCX=/path/to/install/hucx -DUCG_ENABLE_MT=ON -DUCG_BUILD_TESTS=OFF -DCMAKE_C_COMPILER=clang -DCMAKE_CXX_COMPILER=clang++ -DCMAKE_Fortran_COMPILER=flang

      /path/to/install/xucg：表示XUCG的安装路径。

      make -j32

      make -j32 install

      make后面-j参数为并行编译参数，表示有多少CPU核数参与编译过程，请根据实际CPU核数进行指定。

    8. 执行以下命令，加载XUCG环境变量。

      export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/install/xucg/lib:$LD_LIBRARY_PATH

      export C_INCLUDE_PATH=/path/to/install/xucg/include:$C_INCLUDE_PATH

      export CPLUS_INCLUDE_PATH=/path/to/install/xucg/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH

  3. 编译Hyper MPI。
    1. 使用PuTTY工具，以Hyper MPI安装维护用户（例如“hmpi_master”）登录至作业执行节点。
    2. 下载Hyper MPI源码包“hmpi-v2.3.0-huawei.tar.gz”。

      下载地址：https://gitee.com/kunpengcompute/hmpi/repository/archive/v2.3.0-huawei.tar.gz

    3. 将源码包上传至服务器Hyper MPI源码包安装目录，如“/path/to/download/hmpi”。
    4. 执行以下命令，进入源码包安装目录。

      cd /path/to/download/hmpi

    5. 执行以下命令，解压软件包。

      tar -zxvf hmpi-v2.3.0-huawei.tar.gz

    6. 执行以下命令，进入“autogen.pl”脚本所在目录。

      cd hmpi-v2.3.0-huawei/

    7. 执行以下命令，进行Hyper MPI源码包安装。

      ./autogen.pl

      ./configure --prefix=/path/to/install/hmpi --with-platform=contrib/platform/mellanox/optimized --enable-mpi1-compatibility --with-ucx=/path/to/install/hucx --with-ucg=/path/to/install/xucg CC=clang CXX=clang++ FC=flang

      make

      make install

      • 若需要支持GPU Aware功能，且环境上已安装CUDA，则需要执行以下命令，指定--with-cuda参数：

        ./configure --prefix=/path/to/install/hmpi --with-platform=contrib/platform/mellanox/optimized --with-cuda=/path/to/install/cuda --enable-mpi1-compatibility --with-ucx=/path/to/install/hucx --with-ucg=/path/to/install/xucg CC=clang CXX=clang++ FC=flang

      • /path/to/install/hmpi：表示Hyper MPI的安装路径。
      • /path/to/install/cuda：表示CUDA的安装路径。
      • /path/to/install/hucx：表示HUCX的安装路径。
      • /path/to/install/xucg：表示XUCG的安装路径。

配置环境变量

使用MPI的用户，需要配置环境变量，可通过environment-modules工具方式配置环境变量。
  1. 使用PuTTY工具，以Hyper MPI普通用户（例如“hmpi_user”）登录至作业执行节点。
  2. 安装environment-modules工具。
    1. 执行以下命令，安装environment-modules。
      表2 每种操作系统对应安装的操作步骤

      操作系统

      操作步骤
      • CentOS Linux release 7.6 AArch64
      • CentOS Linux release 8.2 AArch64
      • Kylin Linux Advanced Server V10 SP2 AArch64
      • 银河麒麟高级服务器操作系统V10（HPC版） AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）
      • 麒麟信安服务器操作系统V3.5.2 AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）
      • openEuler 20.03 LTS SP3 AArch64
      • openEuler 22.03 LTS SP2 AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）

      yum install -y environment-modules

      Ubuntu 18.04.5 LTS arm64

      apt-get install -y environment-modules
    2. 执行以下命令，查看environment-modules是否安装成功。

      module --version

      若module命令不可用，请先执行以下命令，使module命令生效。

      • CentOS Linux release 7.6 AArch64、CentOS Linux release 8.2 AArch64、Kylin Linux Advanced Server V10 SP2 AArch64、银河麒麟高级服务器操作系统V10（HPC版） AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）、麒麟信安服务器操作系统V3.5.2 AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）、openEuler 20.03 LTS SP3 AArch64、openEuler 22.03 LTS SP2 AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）

        source /usr/share/Modules/init/bash

      • Ubuntu 18.04.5 LTS arm64

        source /usr/share/modules/init/bash

      回显如下类似信息，说明environment-modules安装成功。

      Modules Release 4.1.1 (2018-02-17)
  3. 执行以下命令，在environment-modules工具安装路径下创建并编辑“Hmpi_modulefiles”配置文件。
    1. 打开“Hmpi_modulefiles”配置文件。

      vi /path/to/install/Hmpi_modulefiles

    2. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。
      #%Module1.0
#  HMPI module for use with 'environment-modules' package:
conflict mpi 
prepend-path  OPAL_PREFIX /path/to/install/hmpi/
prepend-path  PATH /path/to/install/hmpi/bin:/path/to/install/hucx/bin:/path/to/install/xucg/bin
prepend-path  LD_LIBRARY_PATH /path/to/install/hmpi/lib:/path/to/install/hucx/lib:/path/to/install/xucg/lib
prepend-path  INCLUDE /path/to/install/hmpi/include:/path/to/install/hucx/include:/path/to/install/xucg/include

      /path/to/install：表示environment-modules工具的安装路径。若用户不指定安装路径，则会安装在默认路径下，不同操作系统的默认路径如下。

      • CentOS Linux release 7.6 AArch64、CentOS Linux release 8.2 AArch64、Kylin Linux Advanced Server V10 SP2 AArch64、银河麒麟高级服务器操作系统V10（HPC版） AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）、麒麟信安服务器操作系统V3.5.2 AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）、openEuler 20.03 LTS SP3 AArch64、openEuler 22.03 LTS SP2 AArch64（不支持OceanStor Pacific存储DPC客户端）的默认路径：/usr/share/Modules/modulefiles
      • Ubuntu 18.04.5 LTS arm64的默认路径：/usr/share/modules/modulefiles
    3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
  4. 执行以下命令，在工具安装路径下加载环境变量。

    module use /path/to/install

    module load /path/to/install/Hmpi_modulefiles

  5. 执行以下命令，将Hyper MPI环境变量写到用户的“~/.bashrc”文件中。
    1. 打开“~/.bashrc”文件。

      vi ~/.bashrc

    2. 按“i”进入编辑模式，添加如下内容。
      module use /path/to/install
module load /path/to/install/Hmpi_modulefiles
    3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。

      默认用户的“~/.bashrc”文件在共享目录中，若不在，请修改所有节点的“~/.bashrc”。

  6. 执行以下命令，使配置生效。

    source ~/.bashrc

父主题： 安装介绍