安装NETCDF-Fortran

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令解压NETCDF-Fortran安装包。

    tar -zxvf netcdf-fortran-4.4.5.tar.gz

  3. 执行以下命令进入解压后的目录。

    cd netcdf-fortran-4.4.5

  4. 执行以下命令进行编译配置。

    CC=mpicc CFLAGS="$optflags -I/path/to/HDF5/include -I/path/to/NETCDF/include" FC=mpif90 FFLAGS="$optflags -fPIC -I/path/to/HDF5/include -I/path/to/NETCDF/include" FCFLAGS="$optflags -fPIC -I/path/to/HDF5/include -I/path/to/NETCDF/include" F77=mpif77 LDFLAGS="$ldflags -L/opt/compiler/BS/bisheng-compiler-1.3.1-aarch64-linux -L/path/to/HDF5/lib -L/path/to/NETCDF/lib" ./configure --build=aarch64-linux --prefix=/path/to/NETCDF --enable-static --enable-shared --with-pic --enable-parallel-tests --enable-largefile --enable-large-file-tests

  5. 执行以下命令合入patch包。

    patch -p1 < libtool.patch

  6. 新建并编辑“libtool.patch”文件。

    1. 新建“libtool.patch”文件。
      vi libtool.patch
    2. 按“i”进入编辑模式,添加如下内容。
      diff -ruN hdf5-1.10.1/libtool hdf5-1.10.1-new/libtool
      --- hdf5-1.10.1/libtool 2019-12-02 20:02:56.270676503 +0000
      +++ hdf5-1.10.1-new/libtool 2019-12-02 20:03:05.062708034 +0000
      @@ -11832,7 +11832,7 @@
       pic_flag=""
       # How to pass a linker flag through the compiler.
      -wl=""
      +wl="-Wl,"
       # Compiler flag to prevent dynamic linking.
       link_static_flag=""
    3. 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。

  7. 执行以下命令进行编译安装。

    make -j$threads

    make install

  8. 执行以下命令验证是否安装成功。

    ls /path/to/NETCDF/bin
    ls /path/to/NETCDF/lib