安装NETCDF-Fortran

操作步骤

  1. 使用PuTTY工具,以root用户登录服务器。
  2. 执行以下命令解压NETCDF-Fortran安装包。

    tar -zxvf netcdf-fortran-4.4.5.tar.gz

  3. 执行以下命令进入解压后的目录。

    cd netcdf-fortran-4.4.5

  4. 执行以下命令设置变量。

    export CPPFLAGS="-I/path/to/SMOKE/HDF5/include -I/path/to/SMOKE/NETCDF/include”
    export LDFLAGS="-L/path/to/SMOKE/HDF5/lib -Wl,-rpath=/path/to/SMOKE/HDF5/lib -L/path/to/SMOKE/NETCDF/lib -Wl,-rpath=/path/to/SMOKE/NETCDF/lib"
    export CFLAGS="-L/path/to/SMOKE/HDF5/lib -I/path/to/SMOKE/HDF5/include -L/path/to/SMOKE/NETCDF/lib -I/path/to/NETCDF/include"
    export CXXFLAGS="-L/path/to/SMOKE/HDF5/lib -I/path/to/SMOKE/HDF5/include -L/path/to/SMOKE/NETCDF/lib -I/path/to/NETCDF/include"
    export FCFLAGS="-L/path/to/SMOKE/HDF5/lib -I/path/to/SMOKE/HDF5/include -L/path/to/SMOKE/NETCDF/lib -I/path/to/NETCDF/include"

  5. 执行以下命令进行编译配置。

    ./configure --prefix=/path/to/NETCDF --enable-shared --with-pic --disable-doxygen --enable-largefile --enable-static CC=mpicc CXX=mpicxx FC=mpifort F77=mpifort F90=mpifort CFLAGS="-O3 -fPIC -Wno-incompatible-pointer-types-discards-qualifiers -Wno-non-literal-null-conversion" CXXFLAGS="-O3 -fPIC -Wno-incompatible-pointer-types-discards-qualifiers" FCFLAGS="-O3 -fPIC" FFLAGS="-O3 -fPIC"

  6. 修改当前文件夹下的“libtool”文件。

    1. 打开“libtool”文件。
      vi libtool
    2. 按“i”进入编辑模式,修改“libtool”文件中第10118和10270行的内容。
      wl='-Wl,'

      执行6.a之后,按“Esc”键,输入“:set nu”,按“Enter”即可显示出行号。

    3. 按“Esc”键,输入:wq!,按“Enter”保存并退出编辑。

  7. 执行以下命令进行编译安装。

    make
    make install