安装HDF5

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令解压HDF5安装包。

   tar -xvf hdf5-1.10.5.tar.gz

3. 执行以下命令进入解压后的目录。

   cd hdf5-1.10.5

4. 执行以下命令进行编译配置。

   CC=mpicc CXX=mpicxx FC=mpifort F77=mpif77 CFLAGS="-fPIC -DPIC" FCFLAGS="-fPIC -DPIC" FFLAGS="-fPIC" \./configure --prefix=/path/to/SMOKE/HDF5 --enable-shared --enable-fortran --enable-static --enable-parallel

5. 修改当前文件夹下的“libtool”文件。
   1. 打开“libtool”文件。

      vi libtool

   2. 按“i”进入编辑模式，修改“libtool”文件中第11835行的内容。

      wl='-Wl,'

      

      执行5.a之后，按“Esc”键，输入“:set nu”，按“Enter”即可显示出行号。

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。

6. 执行以下命令进行编译安装。

   make
   make install

7. 执行以下命令设置HDF5的环境变量。

   export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/HDF5/lib:$LD_LIBRARY_PATH
   export HDF5=/path/to/HDF5