介绍

GROMACS是一个用于分子动力学模拟和能量最小化的计算引擎，其通过牛顿平衡方程来模拟几百到数以百万的原子体系。其设计初衷主要用于生物分子，例如具有大量复杂键联系的蛋白，脂和核酸分子，但GROMACS如今同样被用来计算非生物体系的非键联系，例如聚合物。GROMACS相比其它分子动力学模拟软件具有一些其独有的优势：

• GROMACS免费，其遵循LGPL协议（GNU Lesser General Public License），在Github上可以找到GROMACS的开源代码。
• GROMACS提供相比其他软件更高的性能，在代码上进行了许多的优化。
• GROMACS对于拓扑文件与参数设置文件阅读友好，其与Python的设置格式类似。
• GROMACS的生态环境发展良好，模拟许多分析工具对GROMACS支持都较为优秀。

关于GROMACS的更多信息请访问GROMACS官网。

语言：C++。

一句话描述：分子动力学模拟和能量最小化的计算引擎。

开源协议：LGPL Version 2.1。