安装HDF5

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令加载编译器和OpenMPI。

   export PATH=/path/to/GNU/bin:/path/to/OPENMPI/bin:$PATH
   export  LD_LIBRARY_PATH=/path/to/GNU/lib64:/path/to/OPENMPI/lib:$LD_LIBRARY_PATH

3. 执行以下命令解压HDF5安装包。

   tar zxvf hdf5-1.10.5.tar.gz

4. 执行以下命令进入解压后的目录。

   cd hdf5-1.10.1

5. 执行以下命令进行配置。

   export MPICC=mpicc
   export MPICXX=mpicxx
   export MPIFC=mpifort
   ./configure --prefix=$HDF5 --enable-fortran --enable-static=yes --enable-parallel --enable-shared CC=$MPICC CXX=$MPICXX FC=$MPIFC F77=$MPIFC

6. 执行以下命令进行编译安装。

   make -j 16
   make install

7. 执行以下命令加载环境变量。

   export PATH=/path/to/HDF5/bin:$PATH
   export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/HDF5/lib:$LD_LIBRARY_PATH