运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令创建并且进入工作路径。

   mkdir -p /path/to/CASE
   cd /path/to/CASE

3. 下载测试算例，使用SFTP工具将测试算例上传至服务器“/path/to/CASE”目录。

   下载地址：https://github.com/QEF/benchmarks/tree/master

4. 执行以下命令解压测试算例包，并将需要的文件拷贝到“/path/to/CASE”目录。

   unzip benchmarks-master.zip
   cp -r benchmarks-master/other-inputs/water/* ./

5. 执行以下命令创建“hostfile”文件。
   1. 打开“hostfile”文件。

      vi hostfile

   2. 按“i”进入编辑模式，新增如下内容。

      node1
      node2

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。

6. 重新打开一个登录窗口，使用PuTTY工具，以root用户登录node2服务器。
7. 在node2服务器节点窗口，执行以下命令配置环境变量。
   1. 打开“.bashrc”文件。

      vi /root/.bashrc

   2. 按“i”进入编辑模式，在“.bashrc”文件末尾新增如下内容。

      export PATH=/path/to/GNU/bin:/path/to/OPENMPI/bin:$PATH
      export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/GNU/lib64:/path/to/OPENMPI/lib:$LD_LIBRARY_PATH
      export PATH=/path/to/QE/bin:$PATH
      export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/OPENBLAS/lib:$LD_LIBRARY_PATH

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。

8. 在node1服务器节点窗口，执行以下命令运行QE程序。

   mpirun --allow-run-as-root -np 192 -N 96 -x OMP_NUM_THREADS=1 -hostfile hostfile --mca btl ^openib pw.x -input ./pw.in 2>&1 | tee -a qe.log

   表1 参数说明

   参数	说明
   -np	测试使用的总进程数。
   -N	每个服务器上运行的进程数。
   -x OMP_NUM_THREADS=1	指定每个进程的线程数为1。
   --hostfile	使用的节点名字。

   当QE生成的日志“qe.log”的结尾处出现如图1所示内容时，表示QE程序运行正常结束。

   需要查看“qe.log”日志中的“WALL”数值，单位是“s”，数值越高性能越低，输出的结果如图1所示。

   图1 测试样例