运行和验证

操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入算例文件夹。

   cd /path/to/NWCHEM/NWChem-6.8.1-release/web/benchmarks/dft

3. 执行以下命令创建“hostfile”文件。
   1. 创建“hostfile”文件。

      vi hostfile

   2. 按“i”进入编辑模式，添加如下内容。

      Node1 
      Node2 

   3. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。

4. 执行以下命令清除缓存。

   clush -w Node[1-2] “sync;echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches”

5. 执行以下命令进行计算。

   mpirun --allow-run-as-root -N 96 -x PATH=$PATH -x LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH -mca btl ^openib --hostfile hostfile nwchem siosi8.nw -v 2>&1 | tee   NWChem_examples.log

   

   • --hostfile hostfile：指定使用的节点名字列表，此处以2节点为例。
   • -N 96 ：每个节点运行96个进程（此处以单节点96核CPU为例）。

   需要查看“NWChem_examples.log”日志中的“Total times cpu”数值，单位是“s”，数值越少性能越优。

   输出的结果样例如 图1所示。

   图1 结果样例