tar zxf TEST41.tar.gz
cd TEST41/NHC
echo -e 'node1\nnode2\n…\nnodex' > /path/to/HOSTFILE
“node1、node2、…、nodex”分别为各节点的主机名,可通过命令hostname查询各主机名,“\n”为换行符。
vi /root/.bashrc
export PATH=/path/to/GNU/bin:/path/to/OPENMPI/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/GNU/lib64:/path/to/OPENMPI/lib:$LD_LIBRARY_PATH export PATH=/path/to/DL_POLY/dl_poly-RELEASE-1-10/execute:$PATH
mpirun --allow-run-as-root -np 256 -N 128 -x OMP_NUM_THREADS=1 --hostfile /path/to/HOSTFILE -mca btl ^openib DLPOLY.X
查看“OUTPUT”日志的指标“time elapsed since job start = XX seconds”,时间单位是“s”,数值越少性能越优。
输出的结果样例如图1所示。